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ReacNetGenerator

基于反应分子动力学模拟轨迹的反应网络自动构建和可视化软件

快速上手

轨迹

处理包含原子坐标或键级的轨迹

过滤

基于隐马尔科夫模型的噪声过滤

同分异构体

根据 SMILES 识别同分异构体

网络

使用力引导算法生成反应网络

HTML5

展示可交互的网页结果

快速

包含并行计算和性能优化

# 引用和联系方式

ReacNetGenerator: an automatic reaction network generator for reactive molecular dynamic simulations, Phys. Chem. Chem. Phys., 2020, 22 (2): 683–691, doi: 10.1039/C9CP05091D

[email protected] (Jinzhe Zeng), [email protected] (Tong Zhu)

# 指南和教程

我们提供了使用指南,包括如何安装和使用ReacNetGenerator。我们也提供了一系列教程来帮助你使用Re acNe他Generator。

# 荣誉

  • 2019年(第十一届)上海市大学生计算机应用能力大赛一等奖
  • 2019年(第12届)中国大学生计算机设计大赛一等奖

# 致谢

  • 国家自然科学基金(编号91641116)
  • 国家大学生创新创业训练计划项目(201910269080)
  • 华东师范大学仪器共享平台(001号)