ReacNetGenerator
基于反应分子动力学模拟轨迹的反应网络自动构建和可视化软件
轨迹
处理包含原子坐标或键级的轨迹
过滤
基于隐马尔科夫模型的噪声过滤
同分异构体
根据 SMILES 识别同分异构体
网络
使用力引导算法生成反应网络
HTML5
展示可交互的网页结果
快速
包含并行计算和性能优化
Loading...
# 引用和联系方式
ReacNetGenerator: an automatic reaction network generator for reactive molecular dynamic simulations, Phys. Chem. Chem. Phys., 2020, 22 (2): 683–691, doi: 10.1039/C9CP05091D (opens new window)
[email protected] (Jinzhe Zeng), [email protected] (Tong Zhu)
# 指南和教程
使用conda安装ReacNetGenerator：
conda install reacnetgenerator -c conda-forge
reacnetgenerator -h
我们提供了使用指南，包括如何安装和使用ReacNetGenerator。我们也提供了一系列教程来帮助你使用ReacNetGenerator。
# 荣誉
- 2019年（第十一届）上海市大学生计算机应用能力大赛一等奖
- 2019年（第12届）中国大学生计算机设计大赛一等奖
# 致谢
- 国家自然科学基金（编号91641116）
- 国家大学生创新创业训练计划项目（201910269080）
- 华东师范大学仪器共享平台（001号）